微生物学实验分室主要可承担微生物学实验、农业微生物学实验、环境微生物学实验、微生物生理、生化、遗传实验等教学任务，同时可以承担微生物发酵、环境监测及有害物质检测、微生物与食品保鲜等相关方向的科研工作。主要仪器设备有：紫外、可见分光光度计、PH计、紫外检测仪、PCR仪、电子分析天平、离心机、恒温摇床、多功能磁力搅拌器、漩涡混合仪、数码生物显微镜、台式超声波清洗器、微电脑控制立式高压灭菌器（自动)、接种器械灭菌器、30孔玻璃仪器气流烘干器、冰箱、厌氧罐、电热恒温干燥箱、恒温恒湿箱、霉菌培养箱、LGJ-冷冻干燥机、电热恒温培养箱、手动可调单道移液器、循环水式多用真空泵、超净工作台等。